متحف الطب الأذربيجاني بدأ نشاطه في 29 يناير 1986 بناءً على الأمر رقم 162 الصادر عن وزارة الصحة لجمهورية أذربيجان السوفيتية. تم تنظيم متحف الطب الأذربيجاني بهدف تسليط الضوء على جزء مهم من التراث الثقافي للشعب الأذربيجاني، و تاريخ تطور الطب و الصحة في الجمهورية، و كذلك إنجازات العلماء الأذربيجانيين في مجال العلوم الوطنية و العالمية
يقع المتحف في مبنى مستشفى قراشهر السابق. في هذا المستشفى، عمل رجل الدولة البارز ناريمان ناريمانوف كطبيب بين عامي 1914 و 1917
يحتوي صندوق المتحف على 13,845 قطعة إجمالاً و يستمر في الثراء بالمواد الجديدة بانتظام.
يقوم طلاب جامعة الطب الأذربيجانية، و أطباء معهد تحسين الأطباء، و طلاب مؤسسات التعليم الطبي المتوسطة التخصص، و الضيوف الأجانب و المواطنون المحليون بزيارة المتحف بانتظام.
